IVARSPECIFIKUS MARKEREK FEJLESZTÉSE MENYHAL (LOTA LOTA) FAJBAN FluoMEP MÓDSZERREL
Uri Csilla1, Bakos Katalin1, Daniel Zarski2, Bokor Zoltán1, Urbányi Béla1, Kovács Balázs1
1Szent István Egyetem, Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar, Környezet- és Tájgazdálkodási Intézet, Halgazdálkodási Tanszék, Gödöllő
2Department of Lake and River Fisheries, University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Lengyelország
Kivonat
Vizsgálataink alanyává a menyhalat (Lota lota) választottuk annak ellenére, hogy hazánkban csekély gazdasági jelentőséggel bír. Úgy gondoljuk, ízletes, szálkamentes húsú halként több figyelmet érdemelne. Munkánk célja, hogy minél több információt szerezzünk a faj ivarát meghatározó genomi régiókról, az ott található génekről, azok szerepéről.
Vizsgálatainkhoz egy lengyelországi populációból gyűjtöttünk szexált farokúszó szövetmintákat (32 egyedtől). A szövetekből egy módosított fenol-kloroformos módszerrel tisztítottunk DNS-t, majd „bulk segregant analysis” alapú összehasonlító vizsgálatokhoz 7-9, azonos ivarhoz tarozó egyed DNS-mintájából ún. pool-okat (kevert csoportminta) képeztünk, 2 nő- és 2 hímivarú csoportot hozva így létre. Pool-onként a bemért DNS-oldatok koncentrációja azonos volt, így az egyes egyedek azonos mértékben járultak hozzá a csoportmintákhoz. Mivel a pool-okat az egyedek ivara alapján hoztuk létre, a vizsgálataink során a különböző ivarú csoportok között tapasztalt különbségek nagy valószínűséggel ivarhoz kapcsoltak.
A pool-ok közötti különbségek keresésére egy viszonylag új, PCR technikán alapuló módszert, a FluoMEP-et (Fluorescent Motif Enhanced Polymorphism) választottuk, ami a RAPD analízis egy módosított, nagy felbontású változata, és ötvözi a RAPD és az AFLP technikák előnyeit. Az eljárás genetikai markerek keresésére és genotipizálásra jól használható, lehetővé teszi olyan genomok vizsgálatát is, amelyekről előzetes információval nem rendelkezünk. Érzékenységét, előnyét mutatja, hogy már egy bázispáros különbség (SNP – Single Nucleotide Polymorphism) kimutatására is alkalmas lehet.
Ez idáig közel 60 primerkombinációt teszteltünk. A DNS fragmenteket fluoreszcensen (VIC) jelölt primerekkel amplifikáltuk, majd ezeket kapilláris gélelektroforézissel tettük láthatóvá (ABI-Prism 3130, Applied Biosystems). A genomok mintegy 11000 pontjának összehasonlító elemzését végeztük így el, és 9 lehetséges ivarspecifikus genetikai markert azonosítottunk. Ezen markerek további tesztelése folyamatban van.
A munka az OTKA (105393) támogatásával valósult meg.
Programajánló
Jelenleg nincs aktuális esemény.
Hírek
2021. január 29., péntek, 16:22
Tisztelt Látogatók!
A hazai agrár-felsőoktatás szükséges megújulásának mérföldköve az alapítványi fenntartású Magyar Agrár- és Élettudományi Egyetem (MATE) létrejötte, amely 2021. február 1-től 5 campuson, több mint 13 ezer hallgató számára fogja össze a dunántúli és közép-magyarországi élettudományi és kapcsolódó képzéseket. Az intézményhez csatlakozik a Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ (NAIK) 11 kutatóintézete is, így az új intézmény nem csupán egy oktatási intézmény lesz, hanem az ágazat szellemi, szakpolitikai és innovációs központjává válik, amely nagyobb mozgásteret biztosít a képzések, a gazdálkodás és szervezet modernizálásához, fejlesztéséhez. Az összeolvadással magasabb fokozatra kapcsolunk, a kutatói és egyetemi szféra szorosabban fonódik majd össze, aminek következtében még több érdekes, izgalmas kutatás-fejlesztés születhet majd az agrárium területén.
Kérjük, kövesse tevékenységünket a jövőben is a www.uni-mate.hu honlapon!
2020. október 6., kedd, 08:34
A szokásostól eltérően az idei évben ősszel, október 03-04 között került megrendezésre az Ultrabalaton csapatversenye. NAIK-os csapat az idei évben állt először rajthoz a 14. alkalommal kiírt versenyen.