BALATONI ANGOLNÁKBÓL (ANGUILLA ANGUILLA) ÉS GARDÁBÓL (PELECUS CULTRATUS) KIMUTATOTT CIRCOVÍRUSOK MOLEKULÁRIS ELEMZÉSE
Borzák Réka, Sellyei Boglárka, Székely Csaba, Doszpoly Andor
MTA Agrártudományi Kutatóközpont, Állatorvos-tudományi Intézet, Budapest
Kivonat
A circovírusok kisméretű (12-26 nm), egyszálú körkörös DNS genommal (1,3-2,3 kb) rendelkező, burok nélküli vírusok, melyeket a Circoviridae család Circovirus nemzetségébe soroltak. Általánosságban elmondható, hogy genomjuk ambiszenz irányultságú, mely legalább kettő, a kapszid (Cap) és a replikációért felelős (Rep) fehérjéket kódoló géneket tartalmaz.
A vírust korábban elsősorban a sertés és madár állományokból írták le, mint gazdasági károkat okozó fertőző ágenst, de az utóbbi időben a PCR alapú diagnosztikai teszteknek és a metagenomikai vizsgálatoknak köszönhetően több circovírus-szerű szekvencia került kimutatásra alacsonyabb rendű gerincesekből (kétéltűek, halak), gerinctelenekből és környezeti mintákból is.
A világon először hazánkban írtak le circovírusokat halakból. Ezen eredményekre alapozva megkezdtük a magyarországi természetes vízi halak circovírus fertőzöttségének felmérését a Bioklíma pályázat keretén belül, mely a klímaváltozás hatásait vizsgálja az emberi egészségre és a bioszféra elemeire.
A circovirális DNS jelenlétét széles spektrumú nested PCR-el teszteltük, mely a replikációért felelős (rep) gén egy szakaszát erősíti fel. A felszaporított DNS fragmentek nukleotid sorrendjét kétirányú direkt szekvenálással meghatároztuk, majd az egyes szakaszokra specifikusan tervezett primerek segítségével inverz nested PCR-el megkíséreltük feltárni a cirkuláris genom hiányzó részeit.
Az elmúlt év mintái alapján a vírus meglepően nagy arányban volt kimutatható a Balatonból származó angolnákból. Harmincegy mintából 19-ben sikerült részleges circovírus-szerű szekvenciát kimutatni, ebből 11 azonosnak bizonyult a már korábban leírt European eel circovirus-al (EeCV). A fennmaradó 8 minta 96%-os nukleotid azonosságot mutatott a fent említett szekvenciákkal, és teljesen megegyezett egy balatoni gardából kimutatott részleges circovírus szekvenciával.
A minták feldolgozása még folyamatban van. Eddig 11 angolnából, és a gardából származó circovírusok teljes genomját már sikerült megszekvenálni. Tíz angolnából származó minta megegyezett a korábban leírt EeCV genommal, egy angolna minta pedig a gardából származó circovírus genommal mutatott teljes azonosságot.
A circovírusokat eddig gazda specifikus, illetve szűk gazdaspektrumú vírusokként jellemezték. Ennek ellenére, nekünk sikerült taxonómiailag távol rokon halakból (angolna-garda) ugyanazt a circovírus-szerű szekvenciát kimutatni. Tudomásunk szerint, halak esetében ez az első olyan adat, mely nincs összhangban a circovírusok gazdaspecifikusságára vonatkozó elméletekkel.
A kutatást a KTIA-AIK-12-1-2013-0017, OTKA PD 104315 pályázatok és az MTA Bolyai János Kutatási Ösztöndíj segítségével finanszíroztuk.
Programajánló
Hírek
Tisztelt Látogatók!
A hazai agrár-felsőoktatás szükséges megújulásának mérföldköve az alapítványi fenntartású Magyar Agrár- és Élettudományi Egyetem (MATE) létrejötte, amely 2021. február 1-től 5 campuson, több mint 13 ezer hallgató számára fogja össze a dunántúli és közép-magyarországi élettudományi és kapcsolódó képzéseket. Az intézményhez csatlakozik a Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ (NAIK) 11 kutatóintézete is, így az új intézmény nem csupán egy oktatási intézmény lesz, hanem az ágazat szellemi, szakpolitikai és innovációs központjává válik, amely nagyobb mozgásteret biztosít a képzések, a gazdálkodás és szervezet modernizálásához, fejlesztéséhez. Az összeolvadással magasabb fokozatra kapcsolunk, a kutatói és egyetemi szféra szorosabban fonódik majd össze, aminek következtében még több érdekes, izgalmas kutatás-fejlesztés születhet majd az agrárium területén.
Kérjük, kövesse tevékenységünket a jövőben is a www.uni-mate.hu honlapon!
A szokásostól eltérően az idei évben ősszel, október 03-04 között került megrendezésre az Ultrabalaton csapatversenye. NAIK-os csapat az idei évben állt először rajthoz a 14. alkalommal kiírt versenyen.